Sekwencjonowanie

width=300Sekwencjonowanie przeprowadzono dla czterech członków rodziny. W skrócie, genomowy DNA (około 1,5 ug) dla każdego członka poddano fragmentacji do średniej wielkości 350 bp i poddano tworzeniu biblioteki DNA stosując ustalone protokoły Illumina. Biblioteki przyłączone do ligandu amplifikowano i zindeksowano za pomocą PCR. Następnie bibliotekę hybrydyzowano z biblioteką NimbleGen SeqCap EZ Exome Capture Kit (44M, Roche, Madison, USA) i masowo równoległym sekwencjonowaniem w 90-zasadnych parach przeprowadzono na Illuminie HiSeq 2000, zgodnie z protokołami producenta. Odczyt mapowania i analizy wariantów jest następujący. Surowe odczyty o niskiej jakości lub zawierające adaptery zostały odfiltrowane przed mapowaniem. W przypadku wywoływania SNP odfiltrowane odczyty zostały dostosowane do referencji ludzkiego genomu (UCSC hg19) za pomocą pakietu Short Oligonucleotide Analysis Package (SOAP, V.2.21), a następnie do analizy SNP zastosowano oprogramowanie SOAPsnp (V.1.05). Wyeliminowano SNP o niskiej jakości z oceną jakości genotypu mniejszą niż 20 lub głębokość sekwencjonowania była mniejsza niż 4. W przypadku wywołania indel, do wyrównania użyto Burrows-Wheeler Aligner. Zduplikowane odczyty zostały oznaczone przy użyciu zestawu narzędzi Picard, a zestaw Genome Analysis Tool Kit (GATK) został użyty do wywołania małych indeli.
[podobne: konizacja chirurgiczna szyjki macicy, koronografia ryzyko, kostniak leczenie ]

Bettelheim: Życie i dziedzictwo

Fotografia Bruno Bettelheima na okładce tej nowej i mistrzowskiej biografii zawiera wiele potężnych i sprzecznych obrazów, które przyszły określić tego skomplikowanego człowieka. Siedzi, czytając przed kunsztownym kandelabrem, starszego mężczyznę z wyrazem takiej głębi, że można w nim znaleźć mądrość, znużenie, pogardę, niecierpliwość, ciepło, a przede wszystkim bezpośrednią intensywność. To właśnie autorka, Nina Sutton, urodzona w Wielkiej Brytanii francuska dziennikarka, opowiedziała historię Bettelheima w taki sposób, aby umożliwić ekscytującą eksplorację życia tego niezwykłego człowieka. Bruno Bettelheim jest prawdopodobnie najbardziej znany w tym kraju jako dyrektor Szkoły Orthogennej, szkoły dla dzieci poważnie zaburzonych, związanych z University of Chicago. W latach pięćdziesiątych i sześćdziesiątych ta szkoła zyskała sławę wraz z jej dyrektorem za pionierski sposób wykorzystania intensywnej terapii opartej na zasadach psychoanalitycznych w celu leczenia poważnych zaburzeń psychicznych w dzieciństwie. Read more „Bettelheim: Życie i dziedzictwo”

Więcej na temat mięśnia sercowego

Korespondencja dotycząca łagodnego śluzaka serca, złośliwego świńaka i mięsaka sercowego (problem z 23 maja) 1-3 chmury, zamiast wyjaśniać, jest tematem, który jest ogólnie źle rozumiany przez klinicystów i patologów. Na rycinie przypadku opisanego przez Kairemo i wsp.1 wyraźnie widać, że mięsak sercowy, ale może nieświadomie przyczynić się do powstania złośliwych śluzaków. Większość, jeśli nie wszystkie, zgłoszone złośliwe myksomy są po prostu mięsakami serca, które zostały błędnie zdiagnozowane, w tym w raportach cytowanych w korespondencji.4-6 Dane przedstawione w raporcie Hannah i wsp.4 pokazują mięsaka; Rankin i DeSousa5 nie zapewniają obrazu guza; i Pastakia6 przyznaje, że zgłoszony nowotwór ma histologiczne cechy mięsaka.
Rycina 1. Rycina 1. Read more „Więcej na temat mięśnia sercowego”

Przeprojektowanie kształcenia medycznego absolwenta – lokalizacja i treść

Twój artykuł wstępny (wydanie 15 sierpnia) dotyczy krytycznych problemów w szkoleniu ambulatoryjnym. Niedawno ukończyłem program szkoleniowy z zakresu neurologii, chciałbym podkreślić, że brak odpowiedniej ekspozycji w takich programach na choroby, które są obecnie leczone w biurze. Pacjenci ze stwardnieniem rozsianym i myasthenia gravis są najczęściej postrzegani przez mieszkańców, gdy są przyjmowani do szpitala – to znaczy, gdy są już bardzo chorzy. Choroby takie jak te są skutecznie leczone w warunkach ambulatoryjnych, gdzie mieszkańcy spędzają mało czasu. Jestem odpowiednio przeszkolony do oceny i leczenia pacjentów z ostrymi chorobami neurologicznymi, ale nie tych z przewlekłymi chorobami lub chorobami uleczalnymi w warunkach ambulatoryjnych. Read more „Przeprojektowanie kształcenia medycznego absolwenta – lokalizacja i treść”

olejki do masażu poznań czesc 4

Fibroblasty skóry od pacjenta miały produkt PCR o odwrotnej transkryptazie, który był o 181 bp krótszy niż u zdrowych osobników (Figura 4). Sekwencjonowanie tego produktu wykazało, że ekson IGF-I kontynuował bezpośrednio do eksonu 6, potwierdzając brak eksonów 4 i 5 z cDNA IGF-I (dane nie pokazane). Ta delecja spowodowałaby dojrzewanie dojrzałego peptydu IGF-I od 70 do 25 aminokwasów, a następnie dodatkowej bezsensownej sekwencji z ośmiu reszt i przedwczesnego kodonu stop. PCR odwrotnej transkryptazy cDNA od obojga rodziców dawał zarówno nieprawidłowy produkt jak i produkt o oczekiwanej wielkości. Dyskusja
Nasz pacjent miał homozygotyczną częściową delecję genu IGF-I. Read more „olejki do masażu poznań czesc 4”

Specyficzne dla serca stężenie troponiny I w celu przewidywania ryzyka zgonu u pacjentów z ostrymi zespołami wieńcowymi

U pacjentów z bólem w klatce piersiowej w spoczynku, ale bez uniesienia odcinka ST na elektrokardiogramie, rozpoznania niestabilnej dławicy piersiowej i zawału mięśnia sercowego bez załamka Q są zwykle rozpatrywane łącznie, ponieważ nie można ich rozróżnić klinicznie ani angiograficznie.1-4 Rozróżnienie między nimi zwykle wykonuje się testy na obecność podwyższonego poziomu markera sercowego w surowicy, który wskazuje na martwicę mięśnia sercowego, gdy zawał mięśnia sercowego bez załamka Q. 5 Zakres martwicy mięśnia sercowego jest ważnym wyznacznikiem ryzyka zgonu.6,7. dlatego pożądane jest zidentyfikowanie markera surowicy, którego uwolnienie jest bliskie w stosunku do stopnia uszkodzenia mięśnia sercowego. Taki marker powinien być bardziej czuły niż obecne markery, powinien dostarczać informacji prognostycznych i powinien być mierzalny w ramach czasowych, które pozwalają na leczenie w celu zminimalizowania dalszej martwicy. Ponieważ konwencjonalny marker serologiczny, kinaza kreatynowa i jego izoenzym MB (CK-MB) nie mają wystarczającej czułości i swoistości, istnieje zapotrzebowanie na bardziej czułe i specyficzne dla serca markery martwicy mięśnia sercowego. Read more „Specyficzne dla serca stężenie troponiny I w celu przewidywania ryzyka zgonu u pacjentów z ostrymi zespołami wieńcowymi”

Specyficzne dla serca stężenie troponiny I w celu przewidywania ryzyka zgonu u pacjentów z ostrymi zespołami wieńcowymi

U pacjentów z bólem w klatce piersiowej w spoczynku, ale bez uniesienia odcinka ST na elektrokardiogramie, rozpoznania niestabilnej dławicy piersiowej i zawału mięśnia sercowego bez załamka Q są zwykle rozpatrywane łącznie, ponieważ nie można ich rozróżnić klinicznie ani angiograficznie.1-4 Rozróżnienie między nimi zwykle wykonuje się testy na obecność podwyższonego poziomu markera sercowego w surowicy, który wskazuje na martwicę mięśnia sercowego, gdy zawał mięśnia sercowego bez załamka Q. 5 Zakres martwicy mięśnia sercowego jest ważnym wyznacznikiem ryzyka zgonu.6,7. dlatego pożądane jest zidentyfikowanie markera surowicy, którego uwolnienie jest bliskie w stosunku do stopnia uszkodzenia mięśnia sercowego. Taki marker powinien być bardziej czuły niż obecne markery, powinien dostarczać informacji prognostycznych i powinien być mierzalny w ramach czasowych, które pozwalają na leczenie w celu zminimalizowania dalszej martwicy. Ponieważ konwencjonalny marker serologiczny, kinaza kreatynowa i jego izoenzym MB (CK-MB) nie mają wystarczającej czułości i swoistości, istnieje zapotrzebowanie na bardziej czułe i specyficzne dla serca markery martwicy mięśnia sercowego. Read more „Specyficzne dla serca stężenie troponiny I w celu przewidywania ryzyka zgonu u pacjentów z ostrymi zespołami wieńcowymi”

Kontrolowana próba infuzji interleukiny-2 u pacjentów zakażonych ludzkim wirusem niedoboru odporności

Objawy zakażenia ludzkim wirusem niedoboru odporności (HIV) wynikają z postępującego niedoboru odporności spowodowanego zniszczeniem limfocytów T CD4, co ostatecznie powoduje, że pacjenci zakażeni HIV są podatni na infekcje oportunistyczne i choroby nowotworowe. Podejście oparte na systemie immunologicznym do leczenia zakażeń HIV wykorzystuje farmakologiczne wzmocnienie odporności, aby zapobiec, opóźnić lub odwrócić to pogorszenie.1-3 Takie podejście będzie prawdopodobnie coraz bardziej użyteczne jako tłumienie replikacji wirusa przez kombinacje nowe, silne środki przeciwwirusowe ułatwiają ekspansję układu odpornościowego.4-7 Interleukina-2 jest cytokiną wydzielaną przez aktywowane limfocyty T, które regulują proliferację i różnicowanie limfocytów, w tym limfocytów T CD4. 8-11 Chociaż pomiar obciążenia wirusowego wskazuje, jak szybko układ odpornościowy ulegnie zmniejszeniu, liczba lub procent komórek CD4 pozostaje najlepszym pojedynczym wskaźnikiem zdolności układu immunologicznego do zapobiegania rozwojowi infekcji oportunistycznych.12-16 W niekontrolowanym badaniu pilotażowym przerywana terapia interleukina-2 powodowała utrzymujący się wzrost liczby komórek CD4, głównie u pacjentów z podłożem -line CD4 liczy więcej niż 200 komórek na milimetr sześcienny.17 Aktywacja układu immunologicznego wywołana terapią interleukiną-2 była związana z przejściowym wzrostem obciążenia HIV osoczem u niektórych pacjentów. Aby potwierdzić te wstępne obserwacje i określić długoterminowe skutki nieciągłej terapii interleukiną-2 na obciążenie HIV, przeprowadziliśmy randomizowaną, kontrolowaną próbę przerywanej terapii interleukiną-2 u pacjentów zakażonych HIV z liczbą CD4 większą niż 200 komórki na milimetr sześcienny.
Metody
Projekt badania
Pacjenci w wieku 18 lat i starsi, którzy mieli zakażenie HIV typu i liczba CD4 powyżej 200 komórek na milimetr sześcienny w badaniu przesiewowym kwalifikowali się do rejestracji, jeśli nigdy nie otrzymywali interleukiny-2, nie mieli historii zakażenia oportunistycznego zdefiniowanego jako wskazującego progresję do nabytego zespół niedoboru odporności (AIDS) i nie otrzymywały kortykosteroidów, chemioterapii cytotoksycznej ani eksperymentalnej terapii w ciągu ostatnich czterech tygodni. Read more „Kontrolowana próba infuzji interleukiny-2 u pacjentów zakażonych ludzkim wirusem niedoboru odporności”

Poziomy troponiny sercowej T dla stratyfikacji ryzyka w ostrym niedokrwieniu mięśnia sercowego ad 5

Poziomy troponiny T były podwyższone częściej niż poziomy CK-MB u pacjentów bez uniesienia odcinka ST. Rycina 2. Rycina 2. Prawdopodobieństwo zgonu w ciągu 30 dni według poziomu troponiny T przy przyjęciu do szpitala. Przedstawiono wygładzone estymaty nieparametryczne. Read more „Poziomy troponiny sercowej T dla stratyfikacji ryzyka w ostrym niedokrwieniu mięśnia sercowego ad 5”

Poziomy troponiny sercowej T dla stratyfikacji ryzyka w ostrym niedokrwieniu mięśnia sercowego czesc 4

Analizując wynik 30-dniowej śmiertelności, wykorzystaliśmy splot trzy-węzłowy dla CK-MB i czterozębowy splajn dla troponiny T. Określiliśmy te transformacje na podstawie kryteriów informacyjnych Akaike po przetestowaniu różnych transformacji kandydatów. 25 Trzy zmienne obojętne zostały użyte dla czterokolumnowej zmiennej elektrokardiograficznej. Oceniano także zdolność poziomu troponiny do przewidywania złożonego punktu końcowego, a do tej analizy włączono wszystkich pacjentów, dla których podano dane troponiny T. Wszystkie analizy przeprowadzono za pomocą oprogramowania SAS (wersja 6.09) i S-Plus (wersja 3.3). Read more „Poziomy troponiny sercowej T dla stratyfikacji ryzyka w ostrym niedokrwieniu mięśnia sercowego czesc 4”